Equipe 1 – Diversité génétique, Résistance, Emergence, Interface homme/faune sauvage des maladies infectieuses VIH

Diversité génétique, Résistance, Emergence, Interface homme/faune sauvage des maladies infectieuses

Faits marquants

2014 : origine de l’épidémie VIH en RDC et la trajectoire initiale en Afrique centrale sont publiés dans Science. L’étude a été reprise par de nombreux médias (ex. Bibliothèque Médicis avec JP Elkabbach).

2015 : l’origine des 4 groupes VIH-1 est élucidée, avec la publication dans PNAS des souches SIVgor proche des groupes O et P chez deux populations de gorilles dans le sud Cameroun. Cette étude a aussi été reprise par de nombreux médias.

2016 : premières études montrant un taux élevé de résistances chez les enfants nés de mères séropositives en Afrique (collaboration Togo) ; taux élevés de mutations de résistance chez les patients en échec viral avec des charges virales élevées (Cameroun, Sénégal, Burkina).

2017 : premières publications sur Ebola ; développement d’un nouveau test sérologique avec une bonne sensibilité et spécificité et des études sur la persistance du virus dans le sperme.

2018 : caractérisation rapide de la souche Ebola de l’épidémie dans l’Équateur en RDC qui a permis l’implémentation de mesures de santé publique (ex. vaccination). Félicitations par la chancelière des universités de Montpellier (Mme B. Gille) et la ministre de la recherche (Mme F. Vidal).

2019 : études sur le rôle des chauves-souris et les primates dans l’écologie du virus Ebola, en doublant et triplant respectivement les connaissances précédentes.

Dans les résultats aboutis des travaux conduits en fonction de l’orientation et de l’expertise des membres du groupe « Infections mycosiques et parasitaires liées au VIH », on soulignera une meilleure connaissance de Cryptococcus Afrique/Europe méditerranéenne, Homme/Environnement, Pesticides/résistance

Localisation

Les agents rattachés à l’équipe 1 sont basés sur 2 sites :

• Le groupe « VIH, Ebola et autres infections virales » est basé au centre IRD à Montpellier. Dans le cadre du Laboratoire Mixte International (LMI) PreVIHMI, qui associe le laboratoire de Montpellier avec le CREMER à Yaoundé, Cameroun, et l’INRB à Kinshasa en République Démocratique du Congo (RDC), des membres de l’équipe ont fait des séjours de longue durée (expatriation et/ou MLD (mission de longue durée)) au Cameroun et en RDC. Suite aux études sur Ebola en Guinée des séjours de longues durées ont aussi eu lieu en Guinée. Dans le cadre de ces collaborations, des chercheurs et autres personnels de laboratoire du Cameroun, RDC et Guinée ont aussi été accueillis à Montpellier.

• Le groupe « Infections mycosiques et parasitaires liées au VIH » est situé au Laboratoire de Parasitologie et Mycologie médicale au sein de l’UFR Sciences Pharmaceutiques et Biologiques de Montpellier.

Axes de recherche

– Groupe VIH, Ebola et autres infections virales :

1. Rétrovirus humains :
– documenter la variabilité du VIH en Afrique pour étudier l’origine et l’évolution de l’épidémie,
– documenter la résistance aux antirétroviraux (ARV) en fonction de la diversité du VIH et la prise en charge des patients dans les pays du sud, et dans le contexte de l’accès universel aux ARV,
2. Documenter la circulation de rétrovirus simiens (SIV) afin de surveiller l’émergence de nouveaux VIH,
3. Étudier d’autres agents pathogènes à l’interface Homme/Faune sauvage en Afrique afin d’évaluer le risque d’émergence ou re-émergence d’agents pathogènes chez l’Homme.

– Groupe Infections fongiques et parasitaires axé sur les levures du genre Cryptococcus au travers de :

1.L’épidémiologie et la diversité génétique
2.Les mécanismes moléculaires de la résistance

Ces thèmes sont développés selon une approche multidisciplinaire avec les autres équipes de l’unité.

Projets

Zoonoses-One Health

Arbovirus

Mpox

Renforcement des capacités de séquençage

Coronavirus

HIV

Fièvres hémorragiques

Collaborations et partenariats

A venir…

Membres de l’équipe

VIH, Ebola et autres infections virales

Infections mycosiques et parasitaires liées au VIH